ロシア国家対テロ委員会は3月31日、ダゲスタンの首都マハチカラとカスピスク市で、テロリストらが潜伏していた複数のアパートを特殊部隊が包囲したと発表。対テロ作戦時に適用される法的体制が敷かれた。その後、国家対テロ委員会は、テロを計画していた3人を拘束したと発表した。
ロシア連邦保安庁によると、拘束されたテロリストらは3月22日にモスクワ郊外のコンサートホール「クロッカス・シティ・ホール」で発生したテロの実行犯たちへの資金や武器の提供に直接関与していたことがわかった。彼らはテロの発生直後にロシアから出国するつもりだったという。