コックピットボイスレコーダー（CVR）が発見され、1時間半の音声記録が得られた。記録の全体は厳秘されているが、同紙の手にした断片だけでも、事故の全体像がつかめる。
事故機は10時1分、26分遅れで離陸した。フライトの初っ端、機長が乗客に遅延を詫びている。遅れは取り戻せる、とも。
すこし後で機長、副操縦士アンドレアス・ルビツ氏に、「バルセロナでトイレに寄りそこなった」とぼやく。副操縦士、「いつでも操縦を代わる」と提案するも、機長はこの時点では提案を退ける。
10時27分：同機は高度11600mに達する。ほぼ時を同じくして、副操縦士、機長に対し、「もう（トイレに）行っていいよ」。機長はなお2分ほど操縦室にとどまり、のち「替わってくれ」と頼んで立つ。座席が動く音、ドアが閉まる音。
10時29分：このとき初めて、レーダーが高度の落下をとらえる。
10時30分には100m落下。一分後には600m落下した。
10時32分：管制塔が地上から操縦室との連絡を試みるが、応答なし。自動警報装置が作動する。直後、大きな打撃音が聞こえる。誰かが操縦室へのドアを破ろうしているようだ。
機長の声も聞こえる。「頼むからドアを開けてくれ！」背後からは乗客が大声で叫んでいるのが聞こえる。
10時35分：再びドアを叩く大きな金属音。高度は既に7000mまで落ちていた。90秒後、また自動警報。英語で「Terrain — Pull up — Pull up」と聞こえる。このとき高度は5000m。機長叫ぶ。「ドアを開けろ、この野郎！」
10時38分：同機は全速力でフランス・アルプスに接近。高度は4000m。アンドレアス・ルビツ副操縦士の呼吸音が聞こえる。
10時40分：右翼が山肌に触れる。衝撃音。乗客の悲鳴。これがCVRに記録された最後の音声となった。
