複数のＥＵ諸国が、合意締結に反対の立場を表明している。例えばオーストリア当局は、トルコ人に対するビザ制限を撤廃すれば、ＥＵへのトルコ人移民が増加するとの懸念を明らかにした。またスペインやフランスも、トルコのＥＵ加盟問題は、トルコが自国内で人権を遵守し始めるまで、話し合うべきではないと考えている。
さらに地理的にトルコに近い東欧のブルガリアは「エーゲ海経由でのＥＵへの難民流入を封鎖してしまった場合、今度は難民達は黒海経由で渡って来ようとするだろう。そうなれば、大量の難民が他でもないブルガリア沿岸に直接押し寄せる」と警戒している。
そのほかキプロスは、トルコとの間に大分以前から問題を抱えている。キプロスの北部地域は、1974年以来トルコに占領されたままだ。トルコ政府は、キプロスを独立国家として正式に承認していない。そうした事から、ＥＵとトルコの合意にキプロスは譲歩しないものと予想される。
